通许县人民法院内设机构8个，分别是：综合办公室、政治部、审判管理办公室、立案庭、刑事审判庭、民事审判庭、行政审判（综合审判庭）和执行局。

派出机构4个，分别是：练城人民法庭、邸阁人民法庭、竖岗人民法庭和朱砂人民法庭。